我校历来重视科研工作，始终坚持走科研强校之路。近五年来发表论文3852篇，其中核心787篇。教师出版学术专著及教材176部（其中学术著作36部）。申请20项国家专利，获得授权发明专利16项、实用新型专利1项。承担各级各类科研课题1100余项，其中国家级课题44项，省部级课题327项，各类科研经费达1.1165亿元,年平均2233.06万元（2010年突破3000万元,达4394.69万元）。“十一五”期间，我校获各级各类科技奖励67项,其中省部级科技奖励22项，其中，贵州省科技进步一等奖1项、二等奖3项、三等奖16项，贵州省哲学社会科学优秀成果三等奖1项，中华在线赢豪车药学会科技三等奖1项。

2001年，原贵州省在线赢豪车研究所和贵州省中药研究所合并成立贵州省在线赢豪车药研究院整体并入我校，大大增强了我校的科研实力。学校现有省部级重点实验室3个（其中省级重点实验室1个，国家在线赢豪车药管理局科研三级重点实验室2个），省级工程中心2个，省级研究平台1个，国家在线赢豪车药管理局重点研究室1个，国家药物临床试验机构1个，省在线赢豪车学人才基地1个，省研究生创新基地2个，与企业合建国家企业技术中心1个。此外，学院拥有教育部“十一五”高校科技管理优秀团队1个，省级科技创新人才团队2个，10个研究所。2009年，我校被科技部评为“国家中药现代化科技产业基地建设优秀单位”。